Protein Data Bank
nemzetközi nyílt forrású fehérje- és nukleinsav-adatbázis / From Wikipedia, the free encyclopedia
A Protein Data Bank (PDB)[1] nagy biomolekulák, például fehérjék és nukleinsavak háromdimenziós szerkezeti adatait tartalmazó adatbázis. A jellemzően röntgenkrisztallográfiával, NMR-spektroszkópiával vagy krioelektronmikroszkópiával szerzett, biológusok és biokémikusok által gyűjtött adat szabadon elérhető az interneten tagszervezetei, a PDBe,[2] a PDBj,[3] az RCSB[4] és a BMRB[5] útján. A PDB-t a Worldwide Protein Data Bank (wwPDB) felügyeli.
Protein Data Bank | |
Vállalkozás típusa | krisztallográfiai adatbázis |
Oldal típusa | krisztallográfiai adatbázis |
Elérhető nyelv(ek) | angol |
Alapítva | 1971 |
URL | www.wwpdb.org |
A Wikimédia Commons tartalmaz Protein Data Bank témájú médiaállományokat. |
A PDB fontos a szerkezeti biológia területein, például a szerkezeti genomikában. A legtöbb nagy tudományos folyóirat és társaság a kutatóknak megköveteli a szerkezeti adatok elküldését a PDB-be. Számos adatbázis használ a PDB-ben lévő fehérjeszerkezeteket. Például a SCOP és a CATH fehérjeszerkezeteket csoportosítanak, a PDBsum a PDB-bejegyzések grafikus megjelenítését mutatja más forrásokból származó (például génontológiai) információ révén.[6][7]