ChEBI
From Wikipedia, the free encyclopedia
موجودیتهای شیمیایی مورد علاقه در زیستشناسی، یا به اختصار، "ChEBI"[2][3]یک پایگاه داده شیمیایی و هستیشناسی از موجودیتهای مولکولی متمرکز بر ترکیبات شیمیایی «کوچک» است که بخشی از تلاش هستیشناسیهای زیستپزشکی باز (OBO) در مؤسسهٔ بیوانفورماتیک اروپا (EBI) است. اصطلاح «موجودیت مولکولی» اشاره میکند به: هر «اتم، مولکول، یون، جفت یون، رادیکال، یون رادیکال، کمپلکس، صورتبندی و غیره که بهعنوان موجودیت جداگانهای قابل تشخیص است و از نظر ساختاری یا ایزوتوپی متمایز است.»[4] موجودیتهای مولکولی مورد بحث یا محصولات طبیعی یا محصولات مصنوعی هستند که دارای زیستفعالی بالقوه هستند. مولکولهایی که مستقیماً توسط ژنوم کدگذاری میشوند، مانند اسیدهای نوکلئیک، پروتئینها و پپتیدهای مشتق شده از پروتئینها توسط برش پروتئولیتیک، بهعنوان یک قاعده در ChEBI گنجانده نمیشوند.
محتوا | |
---|---|
توضیح | پایگاه داده شیمیایی |
گونههای دادههای گرفتهشده | ترکیبات شیمیایی کوچک |
تماس | |
مرکز پژوهش | European Molecular Biology Laboratory |
آزمایشگاه | European Bioinformatics Institute |
استناد ابتدایی | de Matos et al[1] |
دسترسی | |
وبگاه | www |
نشانی اینترنتی دریافت | ftp |
نشانی اینترنتی خدمات وب | www |
نقطهٔ پایانی اسپارکل | BIO2RDF |
ابزارها | |
وب | www |
گوناگون | |
تناوب انتشار دادهها | ماهانه |
سیاست گزینش | Manually curated |
ChEBI از نامگذاری، نمادگرایی و اصطلاحات تأیید شده توسط اتحادیه بینالمللی شیمی محض و کاربردی (آیوپاک) و کمیتهٔ نامگذاری اتحادیه بینالمللی بیوشیمی و زیستشناسی مولکولی (NC-IUBMB) استفاده میکند.