Anexo:Cuartos de final del Torneo Apertura 2021 (El Salvador)
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Para la segunda fase del Torneo Apertura 2021, los cuartos de final, clasificaron los ocho equipos mejor ubicados en la tabla de la fase regular. Estos ocho equipos se dividieron en cuatro llaves: llave A, B, C y D. Los equipos posicionados del primer (1.°) al cuarto (4.°) puesto fueron ubicados respectivamente en dichas llaves y los rivales de estos cuatro equipos se definió por sorteo entre los equipos posicionados del quinto (5.°) al octavo (8.°) puesto, para completar los emparejamientos de cada llave. Se jugaron partidos a ida y vuelta, sin tener en cuenta la regla de gol de visitante; los ubicados del primer (1.°) al cuarto (4.°) puesto jugaron el partido de vuelta en condición de locales. En caso de empate en puntos y goles al final de los dos partidos, se definió al equipo clasificado a la siguiente fase por medio de una tanda de penales.